２００９年３月、大阪市立大学、名古屋市立大学、横浜市立大学の３大学は、大都市制度実現に向けた３市連携事業の一環として「３大学連携事業」を推進する協定を締結した。３大学の理念や特色を活かした大学間連携活動を通じ、相互の教育・研究の一層の進展をめざしながら、大都市のあるべき姿を追求するとともに、地域貢献活動や産学官連携、国際学術交流その他の諸活動を積極的に推進することで、優れた人材の育成と真理の探求という大学本来の使命を実現する。
具体的には、３市共同研究会の大都市制度構想提言を受けた大都市制度の研究やシンポジウムの共催を予定している。その他、単位互換制度やそれにあたり必要となる遠隔授業、教職員の人材交流などについても検討。教育の質の向上をめざす。